甘蔗病毒病会在叶片上产生许多不规则的淡绿色或淡黄色的与叶脉平行的短条纹，蚜虫是最主要的病毒传播者，农事操作所造成的机械摩擦和斩过病蔗的蔗刀也会传毒。可以通过盐酸吗啉胍乙酸铜、香菇多糖、菇类蛋白多糖、病毒A、病毒K、芸苔素内酯等来控制病毒。
甘蔗可以选用抗病优良品种，建立健康种苗繁育基地，选用无病种苗。控制蚜虫，减少传播虫媒，砍蔗种前先砍掉有病植株再留种，减少传染源。
