使用酸性药物浸泡，即可杀死果蝇蛹。在日常防治果蝇蛹时，要封闭垃圾箱（桶），保持垃圾箱（桶）底和四周清洁，残余的水果也可成为果蝇孳生地；及时清理、丢弃果皮；及时检查裸露的水果是否被果蝇蛹停留过；及时清洗反复使用的垃圾筐、罐等。
