牡丹花的常见病害为叶斑病和根腐病，叶斑病一般在6-8月发生，可以在5月喷洒波尔多液进行预防。根腐病通常是因为水分太多所致，需要在平时控制浇水，并且注意排水。它的主要害虫是蛴螬，这种虫子会啃食植株的根部，可以用氨水作底肥进行有效防治。
